历时15个月 云南省怒江草果全基因组精密图谱绘制胜利
从20世纪70年代开端,云南省省怒江州就开端种植草果,到2020年,种植面积已达111万亩,不只是全国草果的核心产区,也是当地民众脱贫致富的重要经济作物。
为了加快进步草果遗传改进效率,培育高产、抗病、优质、人身安全新种类,对从源头创新保证草果资产健康可继续发展,2019年9月,怒江州联结华南农业高校等国表里大学科研院所机构,正式启动草果全基因组测序方案,历时1年零3个月,胜利实现草果全基因组测序工作,绘制了精密图谱,并于1月13日正式对外公布。
经过Nanopore及illumina等测序技术,拼接组装得到2.08G大小的基因组,组装出由1145个contig序列组成的草果参考基因组序列,GC含量为40.9%,最长的contig长度为31.6Mb,N50为4.7Mb。结合HiC测序后果,得到24对染色体的高品质基因组,包括42394个基因。经过转录组、代谢组关联剖析,得到草果关键香气物质合成的候选基因一批。草果全基因组精密图谱实现将极大推进草果的全基因组精准育种,为打造国家级草果种质资源圃给个重要根底作用。( 刘文杰)


