美国媒体:美国新型冠状病毒基因测序掉后,许多数据来自几个月前
( 讯)新冠疫情在美国暴发以来,唐纳德•特朗普当局各对付法子广受批判。近期,变异新型冠状病毒病例呈现在美国后,美国媒体留意到国内疫情对付的又一大缺点——病毒基因测序。
美国有线电视网(CNN)1月11日撰文指出,依据病毒数据库GISAID,美国不管是在病毒基因测序的比例上,仍是速度上,都掉后于不少国家。许多医疗资源掉后于美国的国家,如孟加拉、苏里南与斯里兰卡,解决病毒样本的速度都比美国快。
CNN:美国抓取的不少最新新型冠状病毒毒株数据,来自于几个月前
对此,医学专家以为这“很可悲”,并可能造成新病毒变种在人群中的宽泛流传,当局却对此绝不知情。而且,专家们还担心,这可能造成疫苗失效。
样本解决速度上,美国低于苏里南
GISAID数据显示,在从患者身上搜集、剖析并公布病毒样本的速度方面,美国需求85天,排名世界第61位。许多医疗资源少得多的国家,包括孟加拉国、斯里兰卡与苏里南,解决样本的速度比美国快。
关于美国病毒基因测序方面的掉后,贝勒医学院(Baylor College of Medicine)病毒学家彼得·霍特兹(Peter Hotez)博士说:“这很可悲。当你需求等待85天的时候,一个基因序列可能曾经从一种稀有的变异,变为在半数人群中流行的病毒。”
美国疾控中心流感部前主任南希·考克斯(Nancy Cox)也示意:“当许多个国家家都在做得更好,显著更好时,我以为这通知咱们,美国应该群策群力。”
疾控中心先进分子检测办公室主任格雷戈里·阿姆斯特朗(Gregory Armstrong)博士则争辩说,GISAID上的数占有延后,因而具备“误导性”,但他也承认美国在病毒基因测序上“仍需改良”。
去年12月,洛杉矶一处新型冠状病毒检测点磅礴影像图
阿姆斯特朗讲明说,在美国,疾控中心的试验室、国家卫生部份、私人企业与高校都在向GISAID提交序列。“当然,这其实不象征着检测周转时间(TAT,目标本采集到试验室接纳标本的时间)不重要。”
但CNN指出,美国在病毒基因测序上为人诟病,其实不仅仅是由于时间上的迁徙。思考到病毒在美国的“猖狂程度”,美国基因测序的案例真实太少。
依据GISAID数据,美国曾经绘制并公布了近7万名新型冠状病毒传染的样本,这一数字仅次于英国的15万。但是,美国的新冠病例比其余任何国家都多,现在已超越2200万例,远超世界其余国家。
因而,从测序数目的比例来看,美国呈现了不足。依据GISAID数据,美国每一1000例病例内,只发布2.8个基因序列,掉后于34个国家。从绝比照例来看,美国基因测序的病例,只占总病例的约0.3%,排名世界第43位。
GISAID最新数据综合排名:美国每一千病例的测序病例为2.78人,检测时间中位数为84天
去年年末,美国每一周大约对3000个样本进行测序。今年年初,美国疾病管制和预防中心制订了一个指标,在两周内,美国试验室公布的样本数目应该添加到每一周6500个。
阿姆斯特朗说,1月2日至8日的那一周,美国的试验室进行了10619份样本的测序,但此中只管1001份,于过去4周内采集。
对此,考克斯悲观地示意:“难道咱们必需要在所有相关新冠肺炎疫情的事中垫底,或靠近垫底吗?我晓得咱们本能够做得更好,但却没有做得更好,这真的很使人丧气。”
专家:基因测序是关键,可能影响疫苗
哈佛高校公共卫生教授威廉·哈瑟丁(William Haseltine)1月8日在福布斯上撰文指出,基因测序是辨认病毒变异的关键,若测序不力,无法辨认出新的毒株,那么不只前景可骇,疫苗的应用与推广也会遭到影响。
哈瑟丁科普称,基因组测序实质可以获咎DNA分子化学的碱基程序。科学家利用这些序列来辨认基因、监控指令,而在新型冠状病毒的案例下,可以辨认病毒突变。本次疫情早期的测序工作,协助科学家们确定了病毒的构造,让人们意想到这类病毒具备足够的感染性。而近期,测序工作也协助人们辨认了英国与南非呈现的两种变异病毒。
近一年来,新冠基因组学盟(Covid-19 Genomics Consortium)不断在跟踪病毒的变动,记载了超越15万个病毒样本。
然而在美国,基因测序工作却十分滞后。美国曾经呈现来自英国与南非的新毒株,这类流传性标明,触及这些变异病毒的病例曾经十分普遍。但美国缺乏基因组测序,使得变异回避监控。
哈瑟丁指出,病毒在每一次流传到新的宿主时均可能出现了变异。全世界有数万万的记载病例,因而可能另有暗藏的新毒株没有被发现。一些预计显示,仅在美国,就有15-20%的美国人传染了新型冠状病毒,这使得美国病例衍生出一种新的变种,成为可能的情况。假如本土变异存在的话,这可能有助于讲明最近在假日节令察看到的新冠病例激增。
一种更具感染性的毒株在美国蔓延的前景曾经够可骇的了,但若有足够多的变异,一种毒株可能会使现在的疫苗无效,这就是为何必需增强寻觅这些新毒株致力。假如局部人群具备新冠疫苗耐药株,国家公共卫活力构就必需辨认他们,并在此根底上持续疫苗钻研。
最后,哈瑟丁示意,疫苗散发现在已开端推动,生存可能将在2021年恢复正常,但相反的情况也可能出现了。美国与全世界都必需增强病毒基因的测序,辨认与别离新毒株。不然,人类照旧将面对十分漫长的一年。


